Většina kapesních kapesních počítačů se ovládá stylusem a dotykovým displejem. Některá zařízení mají pouze klávesnici, jedná se spíše o digitální diáře. Stylus má mnoho výhod, ale jednu (pro někoho zásadní) nevýhodu – k ovládání je třeba použít obě ruce. Microsoft v současné době pracuje na novém způsobu ovládání, který by se obešel bez stylusu, ten by byl nahrazen uživatelovým palcem.