Rozdíly mezi jednotlivými elektronickými hlodavci jsou zejména v provedení jejich ladných křivek. IntelliMouse Pro je oproti svému předchůdci vyšší a více skloněná. Microsoft se totiž vydal cestou ergonomie, o čemž svědčí i jeho nová klávesnice Elite. Obě tlačítka a kolečko (které je vyrobeno z příjemnějšího materiálu) jsou na svých místech, bohužel myš je určena pouze pro praváky, takže leváci se budou muset buď přizpůsobit nebo se porozhlédnout jinde, např. u Logitechu, jehož nové myši jsou univerzální.
Problém s původní IntelliMouse byl v nepříliš široké podpoře jejího kolečka. To se však změnilo s uvedením poslední verze (2.2) IntelliPoint softwaru s možností univerzálního scrollingu. Windows 98 už mají tuto schopnost, která umožňuje pracovat s kolečkem téměř ve všech aplikacích, přímo zabudovanou.
IntelliMouse Pro je možné k počítači připojit přes PS/2 port nebo pomocí adaptéru přes sériový port. Instalovat IntelliPoint ovladače není nezbytně nutné, Windows 98 mají už zabudovanou i podporu pro kolečko. Ovladače však umožňují, přes ovládací panely, nastavit si myš k obrazu svému. Pod položkou myš naleznete záložky StepSavers, Pointers, Basics, Visibility, Productivity a Wheel.
StepSavers umožňují nastavit pozici kurzoru při práci s dialogovými boxy (SnapTo - kurzor se přemístí na implicitní tlačítko), aktivovat okno při najetí kurzorem na jeho hlavní panel (funkce Focus), ClickSaver nahradí dvojklik kliknutím jediným a SmartSpeed zpomaluje kurzor při pohybu kolem ikon a tlačítek. V sekci Pointers je možné vybrat si z různých tvarů a schémat kurzorů. V Basics lze upravit rychlost a zrychlování pohybu kurzoru (PointerSpeed), je možné zaměnit funkci tlačítek a nastavit rychlost dvojkliku. Visibility nabízí několik možností zviditelnění kurzoru, Sonar pomáhá nalézt kurzor při stisku CTRL, Vanish naopak skryje kurzor při psaní na klávesnici, Trails umožňuje zobrazovat stopu kurzoru a PointerWrap způsobí přeskočení kurzoru na protější stranu při "vyjetí z obrazovky". Odometer na záložce Productivity měří celkovou dráhu, kterou myš při pohybu urazí (uživatelé pak mohou soutěžit, kdo se s myší najezdil nejvíc), ClickLock usnadňuje tažení objektů (není třeba držet tlačítko stále stisknuté, stačí pouze kliknout). Panel Wheel upravuje práci s kolečkem, umožňuje jej zapnout nebo vypnout, povolit nebo zakázat jeho používání jako třetího tlačítka, UniversalScrolling obstarává podporu kolečka i v aplikacích, které pro něj nejsou přímo určeny.
IntelliMouse Pro se prodává za koncovou cenu $69.95, ovšem od svého předchůdce IntelliMouse se příliš neliší, pouze design je poněkud vylepšený, myš je na dotyk příjemnější, možnosti a funkce zůstaly prakticky stejné.
Podle AVault
